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季泉江    助理教授、研究员
所在学院 物质科学与技术学院
研究方向 化学生物学和合成生物学
联系方式 quanjiangji@@shanghaitech.edu.cn
 
  个人简介  
2005年-2009年就读于南京大学化学系获得理学学士学位;
2009年-2014年就读于芝加哥大学化学系,获得化学博士学位(导师为何川教授);
2014年-2016年在加州大学伯克利分校化学系从事博士后研究(合作教授为Michelle Chang 教授);
2016年2月加入上海科技大学物质科学和技术学院,任助理教授。
曾经荣获2013年国家优秀自费留学生奖,Camille and Henry Dreyfus Postdoc Fellow, Everett E Gilbert Memorial Prize等奖项。
  主要研究内容  
课题组致力于基于CRISPR的新型基因组编辑等生物技术开发,基于化学生物学和结构生物学的新型致病机制与耐药机制探索,以及基于小分子或抗体等的新型治疗手段开发等方面的研究:

(1)致病菌基因编辑新技术
CRISPR技术是最新发现的一种高效快速的基因编辑技术。课题组将该项技术应用到人类的致病细菌中,构建能够在各种致病菌中进行高效基因组编辑的工具,为研究致病菌感染和抗药机制,药物靶标筛选等方面提供技术支持。


(2)致病菌感染机制探究和药物开发
研究致病菌中与细菌感染,抗药等相关的蛋白与信号通道,通过解析相应关键蛋白及其与小分子复合物的晶体结构,从分子层面研究细菌的致病机理和潜在的药物靶点,为设计抗菌药物提供分子结构上的支持。同时利用化学生物学、分子生物学和遗传学等手段从生化和表型等方面研究致病菌的感染机制。基于结构信息,理性设计和筛选新型小分子药物以及开发抗体药物。


(3)基因簇抓取
基因簇(gene cluster)指细菌中一组紧密连锁的且功能上密切相关的结构基因。这些基因各自编码的酶通常能组成多酶复合物,催化生命代谢中的特定反应。课题组致力于基于CRISPR基因组编辑技术的新型基因簇抓取和功能研究的技术开发,为研究基因簇上各基因功能等方面提供有效工具。


  代表性论文  


Independent Publications:

 3. Song, L., Zhang, Y., Chen, W., Gu, T., Zhang, S.Y., Ji, Q.* (2018) Mechanistic insights into staphylopine-mediated metal acquisition.  Proc Natl Acad Sci U S A. DOI: 10.1073/pnas.1718382115.

  

2. Gu, T.#, Zhao, S.#, Pi, Y., Chen, W., Chen, C., Liu, Q., Li, M., Han, D.*, Ji, Q.* (2018) Highly efficient base editing in Staphylococcus aureus using an engineered CRISPR RNA-guided cytidine deaminase. Chem Sci. 9, 3248-53.

  

 

1. Chen, W., Zhang, Y., Yeo, W.S., Bae, T., Ji, Q.* (2017) Rapid and efficient genome editing in Staphylococcus aureus by using an engineered CRISPR/Cas9 system. J Am Chem Soc 139: 3790-5.

  

Selected Ph.D. & Postdoc. Publications:


7. Fu, Y., Luo, G.Z., Chen, K., Deng, X., Yu, M., Han, D., Hao, Z., Liu, J., Lu, X., Doré, L.C., Weng, X., Ji, Q., Mets, L., He, C. (2015) N6-methyldeoxyadenosine marks active transcription start sites in Chlamydomonas. Cell. 161, 879-92.


6. Shan, C.#, Elf, S.#, Ji, Q., Kang, H.B., Zhou, L., Hitosugi, T., Jin, L., Lin, R., Zhang, L., Seo, J.H., Xie, J., Tucker, M., Gu, T.L., Sudderth, J., Jiang, L., DeBerardinis, R.J., Wu, S., Li, Y., Mao, H., Chen, P.R., Wang, D., Chen, G.Z., Lonial, S., Arellano, M.L., Khoury, H.J., Khuri, F.R., Lee, B.H., Brat, D.J., Ye, K., Boggon, T.J., He, C., Kang, S., Fan, J.*, Chen, J.* (2014) Lysine acetylation activates 6-phosphogluconate dehydrogenase to promote tumor growth. Mol Cell. 55, 552-65.


5. 
Ji, Q.#, Zhao, B.S.#, He, C.* (2013) A highly sensitive and genetically encoded fluorescent reporter for ratiometric monitoring of quinones in living cells. Chem Commun. 49, 8027-9.


4. Ji, Q., Zhang, L., Jones, M.B., Sun, F., Deng, X., Liang, H., Cho, H., Brugarolas, P., Gao, Y.N., Peterson, S.N., Lan, L., Bae, T., He, C.* (2013) Molecular mechanism of quinone signaling mediated through S-quinonization of a YodB family repressor QsrR. Proc Natl Acad Sci U S A. 110, 5010-5.


3. Sun, F., Ding, Y., Ji, Q., Liang, Z., Deng, X., Wong, C.C., Yi, C., Zhang, L., Xie, S., Alvarez, S., Hicks, L.M., Luo, C., Jiang, H., Lan, L.*, He, C.* (2012) Protein cysteine phosphorylation of SarA/MgrA family transcriptional regulators mediates bacterial virulence and antibiotic resistance. Proc Natl Acad Sci U S A. 109, 15461-6.


2. Ji, Q.
#, Zhang, L.#, Sun, F., Deng, X., Liang, H., Bae, T., He, C.* (2012) Staphylococcus aureus CymR is a new thiol-based oxidation-sensing regulator of stress resistance and oxidative response. J Biol Chem. 287, 21102-9.


1. Sun, F.
#Ji Q.#, Jones, M.B., Deng, X., Liang, H., Frank, B., Telser, J., Peterson, S.N., Bae, T.*, He, C.* (2012) AirSR, a [2Fe-2S] cluster-containing two-component system, mediates global oxygen sensing and redox signaling in Staphylococcus aureusJ Am Chem Soc. 134, 305-14.


(# co-first author; * corresponding author)




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